南方医科大学口腔学院前身为第一军医大学口腔专科班；2004年，第一军医大学更名为南方医科大学；2005年，南方医科大学口腔科成立；2008年升格为南方医科大学口腔医学院。2011年，经上级批准，南方医院第一医院、中级医院“南方医院口腔医院”正式挂牌成立。院长吴步玲教授是我国著名的口腔医学专家。现任中华口腔医学会常务理事，国际牙医学院院士，中华口腔医学会老年口腔医学专业委员会、中华口腔医学会理事长。牙髓病学委员会常务委员、广东省口腔医学会副会长等多项学术职务。
学院设有口腔基础医学、口腔临床医学等多个教研室。拥有世界一流的口腔医学教学实验室，占地2000m2、，包括具有国际水平的日本森田CLINSIM牙科教学头及颌骨模拟实训室。学院每年招收60名五年制本科生。博士、硕士研究生30人。同时，学院实施多层次教育，承担多项继续医学教育项目山南口腔医院公立私立哪家好推荐，举办成人教育大专班。
学院目前承担多项国家、省部级重点科研项目山南口腔医院公立私立哪家好推荐，在龋病病因、牙齿发育机制及其调控等研究领域处于国际水平。同时，重视发展国际交流与合作，与日本大阪齿科大学、该校牙科系等国外口腔医学院建立了长期的学术交流与合作关系。东京大学和加州大学洛杉矶分校牙科学院。
南方医院口腔医院是南方医科大学口腔学院临床科研教学基地。现有口腔医学专业本科及以上学历教师46人，其中教授4人，副教授6人，讲师14人，住院医师22人，其中博士生导师4人，硕士生导师5人，博士后5人，博士生导师。有学位获得者20人，硕士学位获得者13人。医院设有牙髓病学、牙周病学、口腔黏膜病学、老年牙科、口腔修复学、唇腭裂外科、创伤与整形外科、头颈部肿瘤外科、正颌与关节外科、口腔种植学。、口腔正畸科、口腔特需门诊、口腔美容科等临床科室。其中，口腔与牙髓病学专业是国家临床重点专科。医院现有口腔综合治疗台80余个，床位40张，日门诊量400余人次。南方医院口腔医院依托南方医科大学口腔医学院，可将具有国际先进水平的口腔医学院科研成果及时应用于临床，更好地为临床患者服务。目前除了治疗常见的口腔疾病外，还有残根、残冠的保存和修复；四环素牙和氟斑牙的美容修复；牙齿和颅面缺损的种植体修复；眼睛和耳朵缺陷的修复体；颌面整形手术；颌面部头颈部肿瘤；颞下颌关节病；牙周病、口腔黏膜病；复杂牙列缺损的义齿修复；成人正畸；，居国内先进水平。
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